国家海洋局第三海洋研究所（简称海洋三所），创建于1959年11月27日，隶属于国家海洋局，位于美丽的厦门市东海之滨，是国家公益类综合型海洋科学研究机构。
海洋三所目前拥有员工470多人，招收和联合培养在读硕、博士研究生160多人。职工中有中国工 程院院士1人，国家杰出青年基金获得者1人，享受政府特殊津贴专家20余人, 入选国家“百千万人才工程”2人，入选福建省“百千万人才工程”3人，厦门市拔尖人才3人，副高级职称以上科技人员126人，具有硕士、博士学位人员 224人。海洋三所是1984年国务院学位委员会批准的硕士学位授予单位，并与清华大学、中国科技大学等高校联合招收博士研究生，现建有博士后科研工作 站。
海洋三所拥有4大研究领域，16个研究方向，13个研究部门（含2个国家海洋局重点实验室,1个 国家海洋局工程技术中心，依托我所建有 APEC海洋可持续发展中心）。建所50多年来，面向国家需求和国际海洋科学前沿，我所在深海微生物及生物基因资源研究，海洋与全球变化研究，南北极研 究，海洋生物多样性与生态环境保护研究，海洋环境监测技术研究，海洋放射性与海洋核应急技术研究，海洋化学、水文、地质、遥感与声学、海岛、海岸带资源开 发利用与保护规划，海洋生态修复技术研究，海洋生物制药与保健品研发等领域具有特色，开展了大量的基础性、应用性和战略性研究工作，成为海洋强国建设和科 技兴海事业的重要科技力量。
近五年来，海洋三所先后承担完成包括国家“863”、“973”、自然科学基金、重大国家专项在 内的纵向科研项目700多项，已发表论文 1800多篇，其中SCI、EI收录近400篇，出版各类专著、大型调查报告百余部，获得国家自然科学奖1项，国家科技进步奖2项，省部级科技进步三等奖 以上70多项，申请并获得授权专利100多项，部分成果达国际先进水平。
海洋三所厦门所部占地面积6.3万平方米，科研实验与办公用房3万平方米，现有各类先进的海洋仪 器设备2亿多元，其中大型海洋调查仪器设备570余台件、大型实验室分析系统46个；馆藏中外科技书刊8万多册，主办中国自然科学核心期刊《应用海洋学学 报》，是国家海洋标准委员会生物资源开发与保护分技术委员会、中国生态学会海洋生态专业委员会依托单位。拥有我国迄今为止最大的灰鲸标本和十万多份馆藏生 物标本、拥有国家级深海微生物资源库。海洋三所漳州科技兴海基地占地面积145亩，第一期工程正在建设中，该基地将为海洋药物与公共健康产品研发中试提供 重要条件；4500吨级的海洋科学综合调查船“向阳红3号”正在建造中；以海洋中药材培育技术为重点的漳州东山海洋生物资源研发基地正建设启动中。
海洋三所所持有《实验室资质认定证书》、《ISO9001：2008 质量管理体系认证证书》、甲级《海域使用论证资格证书》、甲级《建设项目环境影响评价资格证书》、甲级《工程勘察证书（海洋工程勘察综合类）》、甲级《工 程设计证书（海洋工程设计 - 沿岸工程）》、乙级《工程咨询单位资格证书 - 生态环境与建设工程》、乙级《地质勘察资质证书》、乙级《环境工程设计证书》等各类技术服务证书，在海洋发展规划、环境保护规划和重大基础建设等方面的海 洋管理和海洋经济发展提供了大量的基础性、支撑性技术服务，为我国经济建设、国家安全和海洋科学技术的发展做出了突出贡献。
